木祖村位于木曾区域的东北部，是一个被2000米左右的群山环绕的溪谷型山村。 木曾川全长227公里，木祖村就位于母亲河――木曾川的最上游，是木曾川水系和注入到日本海的信浓川水系的分水岭。由村庄北部发源的木曾川沿村中央南下，大小河流都汇聚于此，这些海拔900～1100米的沿河区域散布着村落和耕地。 全年平均气温8.1度，夏季的气温虽然有时会上升到近30度，但是由于湿气小，所以感觉非常舒适，然而冬天却格外寒冷。村民们利用这种特殊气候，大量生产高原蔬菜，这里的大地培育的实心大白菜“御岳白菜”在市场很受欢迎。从江户时代中期开始制作的“阿六木梳”也是有名的传统工艺品。此外，画布和画框占全国产量的近70％。